Kemono no Sou-ja Erin di kerajaan suci Ryoza dua wilayah dalam keadaan damai. Ratu Harumiya adalah penguasa kerajaan bersama jendral terhebatnya, Adipati Agung. Membela kerajaan dengan pasukan kadal petarung yang dikenal sebagai “Touda”. Meskipun kedua wilayah telah menikmati aliansi dalam waktu lama, ketegangan yang meningkat mengancam untuk memicu perang saudara.

Di Ake, sebuah desa di wilayah Adipati Agung, tempat membesarkan Touda, hidup seorang anak bernama Erin. Dia gadis yang cerdas nan cantik yang menghabiskan hari-harinya mengamati pekerjaan ibunya Soyon, dokter Touda. tapi sementara di bawah perawatan Soyon, sebuah insiden menimpa Touda terkuat Adipati Agung, dan kedamaian yang Erin dan ibunya nikmati kini sirna ketika Soyon dihukum berat. Dalam upaya putus asa untuk menyelamatkan Dunia ibunya, Erin terjatuh di sungai dan terseret ke wilayah Ratu Harumiya.

Tidak bisa kembali ke rumah, Erin harus belajar untuk menjalani kehidupan baru dengan orang-orang yang sama sekali berbeda, semua sambil mencari kebenaran tentang binatang dan manusia itu sendiri, dengan ketegangan antara kedua wilayah terus meningkat.