Katsute Kami Datta Kemono-tachi e cerita di mulai ketika di sebuah daerah di temukan sebuah batu yang memiliki kekuatan khusus. Karena kekuatan besar tersebut perang saudara antara Uni Utara dan Konfederasi Selatan. Salah satu dari mereka kalah dalam jumlah ataupun kekuatan militir, pada akhir nya mereka pun menggunakan kekuatan terlarang. Mereka berhasil prajurit-prajurit menjadi manusia setengah monster yang disebut Inkarnasi, dengan kekuatan tersebut dengan mudah membalikan keadaan dalam perang.

Tapi di titik terang perdamaian antara Uni Utara dan Konfederasi Selatan, pemimpin dari Pasukan Inkarnasi menyadari ada yang tidak beres dengan kekuatan tersebut. Salah satu dari mereka berubah menjadi monster dan tidak bisa mengendalikan tubuh mereka atau sifat manusia mereka sudah hilang. Hal itu membuat ketakutan di pihak militer, setelah perdamaian terwujud Inkarnasi mulai di takuti dan beberapa dari mereka di bunuh. Tapi beberapa dari Inkarnasi melakukan pemberontakan dan mulai membuat onar di mana-mana. Hank yang mrupakan mantan pemimpin dari pasukan Inkarnasi, mulai memburu mereka satu persatu dan menghentikan ke onaran mantan bawahan nya. Apakah Hank bisa menghentikan mereka semua atau mengembalikan sifat manusia mereka?