Shin Kimagure Orange☆Road: Soshite, Ano Natsu no Hajimari sudah beberapa tahun dan Kyosuke Kasuga sekarang berusia 19 tahun. Sebuah panggilan telepon misterius memperingatkannya tentang mobil yang akan datang tetapi dia tidak mendengarkan. Ironisnya, ia tertabrak mobil dan karena kemampuan telepati yang dimilikinya, ia dikirim tiga tahun ke depan. Masa depannya yang berusia 22 tahun sekarang menjadi fotografer yang tersesat di Bosnia dan diyakini telah meninggal.

Kyosuke harus menemukan dirinya yang berusia 22 tahun di masa depan dan memulihkan dirinya, yang berusia 19 tahun, ke waktu yang tepat. Dalam perjalanannya ia bertemu kembali dengan Hikaru yang kini menjadi penari profesional dan terkenal. Madoka juga ada di sana, putus asa karena Kyosuke, 22 tahun, hilang di Bosnia dan Kyosuke, 19 tahun, tertabrak mobil.