Magic Knight Rayearth Season 2 Sedikit waktu telah berlalu sejak konfrontasi terakhir Ksatria Sihir dengan “Mashin” Putri Emeraude. Masih dihantui kematian sang putri, Hikaru Shidou kembali ke Tokyo Tower. Di sana, dia bertemu dengan teman-temannya Umi Ryuuzaki dan Fuu Hououji untuk pertama kalinya sejak pencarian spontan mereka untuk menyelamatkan Cephiro. Diganggu oleh mimpi buruk dari alam yang dia tinggalkan, Hikaru lega menemukan bahwa teman-temannya juga ingin kembali dan melayani kerajaan yang dulu mereka lindungi dengan patuh.

Keinginan para Ksatria Sihir terkabul, karena di puncak Menara Tokyo, ketiganya dibutakan oleh cahaya besar yang sama yang mereka lihat pada hari pertama mereka bertemu. Sekali lagi di belakang seekor ikan terbang, kelompok itu kembali ke Cephiro — dunia yang sekarang sunyi dan hancur. Dengan runtuhnya kekuatan Pilar, monster dengan bebas berkeliaran di daratan sementara tiga negara berusaha untuk mencaplok Cephiro dengan harapan merebut Pilar untuk diri mereka sendiri. Hal-hal yang lebih rumit adalah Lady Debonair yang misterius, yang menyatakan dirinya sebagai pewaris sah negara yang jatuh.

Sekarang menghadapi taruhan yang lebih besar dan musuh yang sangat berbeda, ketiga Ksatria Sihir berangkat sekali lagi untuk menyelamatkan Cephiro dan membawa perdamaian. Dengan ikatan yang telah mereka jalin bersama, ketiganya bersatu dalam menghadapi tantangan yang begitu besar.