Kidou Senshi Gundam: Fukushuu no Requiem berlatar di Universal Century 0079, pada saat Principality of Zeon menyatakan kemerdekaan dari Earth Federation, yang kemudian memicu perang besar. Dengan teknologi Mobile Suit baru mereka, pasukan Zeon awalnya berhasil memegang kendali atas konflik tersebut, namun tidak mampu mengamankan kemenangan penuh, menyebabkan situasi perang yang terus berlanjut.

Ceritanya berfokus pada kelompok pasukan Earth Federation yang berhasil merebut kembali sebuah pangkalan yang sebelumnya dikuasai oleh Zeon di Eropa Timur. Salah satu tokoh utamanya adalah Sorari, bersama dengan pasukan Red Wolves, divisi Mobile Suit khusus yang baru saja kembali dari luar angkasa. Serial ini menggambarkan pertempuran sengit mereka serta konflik pribadi yang dihadapi saat berusaha bertahan dalam kekacauan perang