Gyokou no Nikuko-chan Bercerita tentang wanita yang berusia 38 tahun yang bernama Nikuko yang tinggal bersama putrinya yang bernama Kikuko. Meskipun sudah dewasa dan mempunyai anak, tapi kehidupan mereka jauh dari kata layak. Pasalnya Nikuko bersama dengan putrinya harus hidup diatas sebuah perahu. Selain itu sikap yang dimiliki Nikuko sangat jauh dari sesosok wanita yang tangguh. Bahkan Kikuko seringkali kesal karena melihat tingkah laku ibunya. Anime ini menceritakan tentang pertumbuhan serta kehidupan Nikuko dan Kikuko sebagai sepasang ibu dan anak.