Bishoujo Senshi Sailor Moon R melanjutkan kisah sebelumnya Usagi Tsukino dan teman-temannya telah hidup damai. Sampai mereka dipanggil untuk beraksi lagi sebagai pahlawan galaxy yang berjuang untuk perdamaian galaksi. Usagi, juga dikenal sebagai Sailor Moon, memimpin kelompok mereka ke dalam pertempuran ketika ancaman baru dari luar angkasa. Yaitu muncul dua orang yang selamat dari ras alien An dan Ail, Untuk menyelamatkan sumber tenaga hidup mereka. Yaitu Pohon Makai, An dan Ail mulai mengambil energi dari manusia. Mereka harus menghentikan rencana para alien tersebut atau menghadapi kehancuran Bumi untuk yang kedua kalinya. Gimakah kisah selanjutnya? Kita saksikan saja!!