Triage X bercerita tentang serangan teroris yang mematikan, Arashi Mikami nyaris lolos dari kematian namun kehilangan semua yang ada dalam dalam kejadian tersebut, termasuk keluarga dan sahabatnya yang dia cintai. Namun, ahli bedah yang menyelamatkannya jauh dari sekedar dokter biasa-dia memerintahkan tim pemogokan yang dikenal sebagai Black Label (nama minuman nih haha) yang tugasnya untuk memusnahkan penjahat mematikan yang telah membunuh banyak orang. Dipenuhi tekad baru, Arashi bergabung dengan barisan organisasi yang suka membunuh para penjahat dengan kejam.