Zoids Shinseiki/Zero mekanisme tempur berbentuk hewan yang kuat — tidak lagi digunakan dalam peperangan, tetapi dalam kompetisi olahraga yang terorganisir. Tim Blitz, sekelompok pilot berjuang untuk mengukir ceruk untuk diri mereka sendiri di liga pertempuran Zoid, mengalami keberuntungan ketika Bit Cloud, pengedar sampah gelandangan, mengembara ke tengah-tengah mereka dan membuktikan dirinya mampu mengemudikan Liger Zero yang temperamental.

Zoid yang menolak untuk membiarkan orang lain masuk ke kokpitnya. Dipimpin oleh Bit and the Liger, Tim Blitz dengan mantap membuat jalan mereka ke puncak — tetapi di sepanjang jalan mereka menarik perhatian yang tidak diinginkan dari Backdraft Group, sebuah organisasi pilot Zoid yang beroperasi di luar undang-undang yang ditetapkan oleh Komisi Pertempuran Zoid. Backdraft ingin Zoids yang kuat untuk ditambahkan ke barisan mereka, dan mereka mengincar Liger Zero …